Başkanlığımız, Ulusal kalkınma stratejileri ve politikaları, yıllık program ve hükümet programı kapsamında Üniversitemizin orta ve uzun vadeli strateji politikaları çerçevesinde,  kamu ve Üniversitemiz  kaynaklarının etkili, ekonomik ve verimli bir şekilde elde edilmesi ve  kullanılmasını, hesap verebilirlik ve  mali saydamlığa dayalı mali yönetim  yapısını ve  işleyişini, Üniversitemiz bütçelerinin, hazırlanmasını, uygulanmasını,  değerlendirilmesini, ödeneklerinin ihtiyaca göre belirlenmesini, tüm mali işlemlerin  muhasebeleştirilmesini,  raporlanmasını ve mali kontrolü yapmayı misyon edinmiştir.